现为公安九课少校的草薙素子(坂本真绫配音),按照课长荒卷大辅(塾一久配音)的指示外出调查运输机被神秘并机的事件。结果途中遭到巴特(松田健一郎配音)率领的武装分子的袭击。与此同时,遍布全国的交通管制系统也意外瘫痪。一切源于前七八联合部队的长官曾我和哉(泽木郁也配音),他因制造难民虐杀事件遭到国家指控,而他的下属坚信这一切都是国家阴谋。曾我不甘被污,因此试图通过网络揭露大国的丑行。素子在调查过程中渐渐了解真相,而她也朝着组建自己的部队迈出重要的一步…ddd 本片为攻壳机动队前传“ARISE”的第二部。